第1章分子生物学基础
1.1生命的基本物质
1.2基因表达遗传信息的流动
1.3生物序列处理
第2章计算机技能基础
2.1文本编辑器
2.2网络搜索
2.3常用生物软件
2.4Windows 10的Linux子系统安装与使用
第3章生物数据库
3.1NCBI综合数据库
3.2一级数据库与二级数据库
3.3NCBI查找胰岛素基因序列
第4章序列比对（alignment）
4.1序列比对基础
4.2动态规划算法（dynamic programming）
4.3全局比对与局部比对
4.4多重序列比对
4.5双序列比对实践
4.6BioEdit进行多序列比对、编辑与美化
第5章序列数据库搜索（BLAST）
5.1BLAST算法
5.2NCBI网站BLAST搜索
5.3本地BLAST
第6章系统发育树(Phylogenetic Tree)
6.1分子系统发育树的基本概念
6.2分子系统发育树的构建方法
6.3MEGA构建进化树实训
第7章蛋白质结构预测
7.1蛋白质三维结构的确定方法
7.2蛋白质三维结构数据库
7.3蛋白质三维结构可视化
7.4蛋白质三维结构的同源建模
第8章PCR引物设计（PCR Primer Design)
8.1引物设计原则
8.2实时荧光定量PCR技术的原理与方法
8.3Primer Premier5的使用
第9章DNA测序（DNA Sequencing)
9.1DNA测序方法
9.2碱基读取（Base Calling)
9.3Sanger测序结果分析
第10章基因组学
10.1基因组测序策略
10.2基因组组装与注释
10.3模式生物基因组
10.4微生物基因组比对与可视化
第11章下一代测序基础
11.1NGS测序文库制备
11.2Ilumina测序原理
11.3NGS数据的质量控制
11.4测序数据质控分析实践
第12章全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)
12.1短读段比对（Reads Mapping)
12.2变异识别（Variants Calling)
12.3全基因组重测序分析实践
第13章基因组组装（Genome Assembly）
13.1基因组组装的影响因素及测序策略
13.2序列组装过程
13.3组装质量的评价
13.4基因组组装实践
第14章转录组测序（RNA-Seq)
14.1RNA-Seq实验设计及测序策略
14.2RNA-Seg数据分析流程
14.3RNA-Seq数据分析实践
第15章宏基因组学（Metagenome)
15.1基于NGS的两种宏基因组研究策略
15.2实验设计与测序的影响因素
15.3扩增子测序数据分析
15.416S rDNA扩增子数据分析实践
参考文献
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