《海洋微生物工程》通过对海洋微生物的特性、类群及资源分布等基础知识的介绍，以及海洋微生物开发利用技术、海洋微生物酶及天然产物工程、深海与地微生物工程、海洋微生物与食品工程、地球工程、海洋生态修复工程、能源工程等应用型和工程化内容的阐述，来介绍海洋微生物工程这一新兴领域的基础知识、现代技术、工程范畴及发展趋势。

绪论
第一章 海洋微生物资源概述
第一节 海洋微生物的基本特征
第二节 海洋细菌
第三节 海洋古菌
第四节 海洋真核微生物
第五节 海洋病毒

第二章 海洋微生物研究方法与工程技术
第一节 海洋微生物的分离和培养技术
第二节 海洋微生物的检测和鉴定技术
第三节 海洋微生物天然产物筛选技术
第四节 海洋微生物发酵工程技术

第三章 海洋微生物天然产物工程
第一节 海洋微生物胞外多糖
第二节 海洋生物毒素
第三节 不饱和脂肪酸
第四节 其他海洋微生物天然产物

第四章 海洋微生物酶工程
第一节 蛋白酶
第二节 脂肪酶
第三节 多糖降解酶
第四节 溶菌酶
第五节 海洋噬菌体聚糖酶

第五章 海洋微生物与生物制药工程
第一节 概述
第二节 海洋细菌与生物制药工程
第三节 海洋放线菌与生物制药工程
第四节 海洋真菌与生物制药工程

第六章 海洋微生物与食品工程
第一节 海洋食品原料中的微生物危害
第二节 传统海洋发酵食品
第三节 海洋食品原料的高值化生物转化工程技术
第四节 海洋微生物在食品安全控制中的应用

第七章 深海与极地微生物工程
第一节 深海与极地微生物多样性与适应性机制
第二节 深海与极地微生物生物活性物质
第三节 深海与极地微生物研究与开发技术

第八章 微生物与海洋生态修复工程
第一节 陆源污染及其生物修复
第二节 海水养殖水域污染及其生物修复
第三节 海洋石油污染及其生物修复
第四节 赤潮的发生与微生物控制
第五节 海洋环境监测中的微生物技术

第九章 海洋微生物与地球工程
第一节 微生物在海洋地球化学循环中的作用
第二节 微生物对海洋环境变化的响应
第三节 海洋地球工程中的微生物调控技术

第十章 海洋微生物与能源工程
第一节 微生物对海洋成油成气的影响
第二节 生物柴油
第三节 燃料乙醇
第四节 其他类能源
参考文献