《化学学科理解系列丛书》的编写目的之一，是搭建中学化学学科知识与大学化学学科知识之间的桥梁。物质结构篇在物质结构学科理解内容的选择和组织上，以五个主题模块形式呈现。
　　《化学学科理解系列丛书：物质结构篇》的读者对象主要是职前化学教师（包括本科师范生和化学教育硕士研究生）和在职一线化学教师。
　　《化学学科理解系列丛书：物质结构篇》可作为高等师范院校化学本科师范生、化学教育硕士研究生“学科理解类”课程的教材，也可作为《普通高中化学课程标准》（修订版）培训的参考书，以及“国培计划”化学教师培训的参考书。

　　伴随着《普通高中化学课程标准》（修订版）的颁布，以发展学生化学学科素养为标志的新一轮基础化学课程与教学改革正式启动。
　　发展学生的化学学科核心素养，开展“素养为本”的化学课堂教学，对化学教师提出了新的挑战。为此，“课标”（修订版）中明确提出中学教师应“增进化学学科理解”“提高化学学科理解能力”。
　　物质结构学科理解是指教师对物质结构学科知识及其思维方式和方法的一种本原性、结构化的认识。它不仅仅只是对物质结构知识的理解，还包括对具有物质结构学科特质的抽象思维方式和各种模型化（包括数学的、物理的和空间结构的）思想的理解。其理解的程度不是停留在原子、分子尺度层面上对物质间相互作用的特征进行浅表性的、散点式的解读，而是深入原子、分子内部的电子层次，基于电子运动的“波粒二象性”本质属性，对物质间相互作用的微观机理做出本原性的解释，并加以结构化的统整。从而，系统明晰物质结构乃至整个化学学科关于诸如一个原子是否有能力与其他原子或基团相结合、可以与几个原子或基团相结合、原子间以什么样的空间排布相连接等学科核心问题。
　　编写《化学学科理解系列丛书》的目的之一，是搭建中学化学学科知识与大学化学学科知识之间的桥梁。它既不是大学化学学科知识的简单重复，也不是中学化学学科知识的简单解答，而是从中学化学教师发展学生化学学科核心素养的需要出发，对化学学科知识及其认识方式和方法从本原上进行重新统整。为此，课题组在充分研讨的基础上创造性地抽提出关于物质结构等学科领域的学科核心视角和核心概念的认识模型。
　　在针对性和创造性原则的基础上，结合“有用”“好用”和“管用”的指导思想，在物质结构学科理解内容的选择和组织上，依照人们认识物质世界的系统层次，沿着轨道重叠和空间结构两条发展主线，以五个主题模块形式呈现：
　　第一章 化学微观视角是如何形成的
　　第二章 轨道思想是如何建构的
　　第三章 元素周期律的微观本质是如何揭示的
　　第四章 化学粒子间相互作用的轨道重叠思想是如何体现的
　　第五章 晶体是如何解构的
　　其中第一、二章分别给出了认识视角和认识思路，二者结合在上位给出了物质结构学科的思维方式。第三、四、五章是运用给出的思维方式解决原子结构、分子结构和晶体结构中的问题，具体问题的载体是中学化学中重要的学科思想主题。原子结构的核心主题选择的是元素周期律，历史中元素周期律本质的逐步揭示和认识对应着量子化学理论的发展和应用。分子结构的核心主题选择的是粒子间的相互作用，将粒子间的相互作用运用“轨道重叠思想”打通并统一。晶体结构的核心主题选择的是粒子有序聚集所产生的对称性，对于粒子在晶体中为什么和如何有序聚集进行本原性解释。由此发掘的辩证逻辑是物质系统向认识系统的反馈，为读者提供知识迁移的情境，展现多角度的透视，引发多方位的思索，促动读者自主完成知识建构，自觉地以多维立体交叉思维代替简单的线性因果联想。